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微波化学反应器是进行微波催化反应的微波化学仪器，主机控制部分采用微电脑技术和的微波调整技术，从而实现微波功率连续可调。面板有功率表显示，操作简单、应用效果好，适用于摸索微波催化反应条件的微波化学实验，特别是要求微波功率较小又希望保持连续微波辐射的微波化学实验。
微波化学反应器的工作原理：
一、封管实验：从微波炉和操作者的安全性考虑，必须切实注意以下几点：
1、已知会产生气体的反应，不可做封管实验；
2、封管必须由耐压的95材料玻璃制成；反应材料的量必须严格控制。
3、如反应物量少并无须搅拌，可用50ml或100ml烧瓶。将聚四乙烯盘架置于炉底中央，再将直接管由炉穿过截止波导插入烧瓶，在炉顶上方安排合适的回流装置。
4、底部有磁力搅拌器，顺时针旋转转速由低到高变化。如反应量大或需要插入搅拌器（注：搅拌器必须是玻璃或四氟乙烯制，不可用金属制品），则用50ml-250ml烧瓶。直接管由炉顶穿过截止波导查体烧瓶口，上配U形口或Ψ形三口连接管，再安排搅拌器、回流装置及滴液漏斗等。
二、固相化学反应：根据反应需要灵活安排反应器和工作方式，但必须遵循以下原则；
1、产生气体的反应，特别产生腐蚀性、刺激性气体的反应，容易对电路和电脑板造成损害。应该安装回流装置并通过导管引出炉外抽走。
2、反应物和生成物的介电常数和介质损耗不同，在微波场对微波的吸收会有差异，反应一段时间往往发生局部温差，所以固相反在进行过程中常常需要中途作翻拌、振摇并选择较低的功率档，使反应尽可能得以均匀进行。
3、微波反应器中任何化学反应都不允许放在敞口容器里进行，更不允许放在密闭容器里进行。因前者可以造成喷溅污染腔体；后者有发生爆炸的危险。